Селекционная работа с кукурузой, основанная на использовании явления гетерозиса, предполагает постоянный процесс создания и оценки новых гомозиготных линий. Процесс довольно трудоемкий, требующий многих лет работы для получения селекционно-качественного материала. Разработка технологии массового, ускоренного метода создания новых высокогомозиготных линий кукурузы представляется исключительно удобной и дополняющей традиционный метод инбридинга. В основе технологии ускоренного получения новых линий кукурузы, лежит метод гаплоидии, основанный на генетическом маркировании и массовом отборе гаплоидов по цвету зародыша и алейрона, предложенный американским ученым Ш. Чейзом в 1952 году. С применением метода гаплоидии и генетического маркирования в селекции кукурузы значительно сокращает селекционный процесс и позволяет перейти на новый перспективный уровень работ, уменьшая необходимое время для получения селекционно-ценных линий с 15-20 до 5-7 лет.
Использование гаплоидных особей для увеличения частоты отбора благоприятных генов в исходном материале имеет ряд преимуществ перед использованием диплоидов.
1. На гаплоидном уровне проявляются все гены, как доминантные, так и рецессивные. Отсутствуют аллельные взаимодействия, что облегчает проведение отбора генов, контролирующих наличие положительных признаков (например, такого селекционно-ценного признака, как двухпочатковость) и помогает выбраковке особей содержащих гены с отрицательными признаками.
2. Развитие матроклинных гаплоидов происходит из неоплодотворенной яйцеклетки, в связи с чем, расщепление среди гаплоидов соответствует расщеплению женских половых клеток, гамет. Поэтому, вероятность получения желаемой комбинации генов выше у гаплоидов, чем у диплоидов.
3. При выращивании гаплоидных растений, происходит очищение естественным путем исходного материала от вредных рецессивных генов, снижающих жизнеспособность и продуктивность растений. Гаплоидные формы, содержащие летальные и полулетальные гены, или гибнут, или стерильны и не могут быть включены в дальнейший селекционный процесс.
4. Использование гаплоидных особей для ускоренного получения высокогомозиготных линий из гибридных комбинаций или синтетических популяций.